Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt27Q9Z320 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms