Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn8Q9Z260 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms