Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms