Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc4Q9QZD4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms