Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx8Q9QXV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms