Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip4Q9QXN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip4Q9QXN3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms