Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms