Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf1Q9QX66 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf1Q9QX66 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms