Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cul3Q9JLV5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms