Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp1Q9JLK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp1Q9JLK7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms