Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr10Q9JL21 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr10Q9JL21 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms