Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nova1Q9JKN6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms