Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx6Q9JKK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms