Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms