Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gpa33Q9JKA5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gpa33Q9JKA5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms