Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms