Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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