Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alyref2Q9JJW6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms