Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms