Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim2Q9ESN6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms