Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem27Q9ESG4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms