Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc4Q9ES56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms