Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms