Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms