Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms