Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms