Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic1Q9DC16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic1Q9DC16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic1Q9DC16 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms