Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms