Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med27Q9DB40 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms