Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mcts1Q9DB27 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Mcts1Q9DB27 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mcts1Q9DB27 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mcts1Q9DB27 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms