Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf4Q9DAW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms