Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc89Q9DA73 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms