Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd8Q9DA37 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms