Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms