Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc91Q9D8L5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms