Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfrsf13cQ9D8D0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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