Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Jam3Q9D8B7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Jam3Q9D8B7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Jam3Q9D8B7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Jam3Q9D8B7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Jam3Q9D8B7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms