Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms