Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Borcs8Q9D6Y4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms