Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gabra4Q9D6F4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gabra4Q9D6F4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gabra4Q9D6F4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gabra4Q9D6F4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gabra4Q9D6F4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra4Q9D6F4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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