Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms