Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms