Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Odf2lQ9D478 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2lQ9D478 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2lQ9D478 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2lQ9D478 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Odf2lQ9D478 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms