Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D454 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D454 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D454 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D454 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D454 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D454 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D454 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D454 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D454 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D454 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms