Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt20Q9D312 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms