Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Senp8Q9D2Z4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Senp8Q9D2Z4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms