Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms