Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms