Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms