Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms